高通量测序

DNA样本

测序类型	浓度	总量	完整性	纯度
基因组重测序/动植物de novo测序	/	≥400ng	无明显降解	/
基因组重测序（PCR-free）	/	≥3μg	无明显降解	/
外显子测序(WES)	/	≥500ng	无明显降解	/
全基因组甲基化测序	/	≥2μg	无明显降解	/
宏基因组	/	≥400ng	片段大小≥500bp	/
三代Sequel基因组测序（20K及以上）	≥80ng/μl	≥20μg	清晰无降解/主带集中在30kb以上	260/280比值1.8-2.0，Nanodrop浓度与Qubit浓度比值≤2
三代Sequel基因组测序（10K）	≥60ng/μl	≥5μg	无明显降解	260/280比值1.8-2.0，Nanodrop浓度与Qubit浓度比值≤2
Chip-seq	/	≥50ng	主峰100-500之间的smear条带	/
扩增子测序	/	≥100ng	主峰100-550之间的单一条带	/
扩增子测序（PCR-Free）	/	≥2μg	主峰100-550之间的单一条带	/
AAV二代测序	/	≥400ng	无明显降解	/
AAV三代测序	/	≥5μg	无明显降解	260/280比值1.8-2.0
三代Sequel扩增子（800bp-3kb）	≥20ng/μl	≥2μg	主带清晰且单一	/
三代Sequel扩增子（3kp-10kb）	≥50ng/μl	≥5μg	主带清晰且单一	/
全质粒测序	要求标准浓度20ng/μl	≥400ng	条带清晰无降解	260/280比值1.8-2.0， OD260/230≥2.0

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RNA样品

RNA样品建议在-80℃以下的环境中保存。短时间保存或运输可以使用干冰或者液氮。长时间运输，建议将RNA沉淀于75%乙醇中，采用足量干冰或者蓝冰运输（2 kg/day）。说明：

测序类型	浓度	总量	完整性	纯度
真核转录组测序（非链特异性/链特异性）	≥50ng/μl	≥1.5μg	RIN≥6.5/无明显降解	/
长链非编码RNA测序（LncRNA）（链特异性/非链特异性）	≥100ng/μl	≥2μg	RIN≥6.5/无明显降解	/
原核转录组测序	≥100ng/μl	≥2μg	RIN≥6.5/无明显降解	/
Small RNA测序	≥200ng/μl	≥3μg	RIN≥7.5/无明显降解	/
全转录组测序	≥200ng/μl	≥5μg	RIN≥7.5/无明显降解	/
三代全长转录组	≥45ng/μl	≥2μg	RIN≥8	260/280比值≥1.8
免疫组库测序/杂交瘤测序	≥100ng/μl	≥2μg	无明显降解	/
二代mRNA QC	≥20ng/μl	≥500ng	条带清晰无降解	/
三代mRNA QC	≥150ng/μl	≥2μg	条带清晰无降解	/

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组织样本

文库类型	检测项目	采集样本类型	推荐送样量
DNA文库	基因组重测序/动植物de novo测序	血液	≥500μl
		新鲜组织	≥200mg
		细胞	≥5x106
		FFPE	≥10片
		植物组织	≥500mg
		菌体	≥300mg
	基因组重测序（PCR-free）	血液	≥1ml
		新鲜组织	≥500mg
		细胞	≥1x107
		植物组织	≥1g
		菌体	≥800mg
	外显子测序(WES)	血液	≥1ml
		新鲜组织	≥200mg
		细胞	≥5x106
		FFPE	≥10片
		植物组织	≥500mg
	全基因组甲基化测序	血液	≥1ml
		新鲜组织	≥300mg
		细胞	≥1x107
		植物组织	≥1g
	宏基因组	土壤	≥500mg，情况较多，建议参考送样指南
	宏基因组	粪便	≥500mg，情况较多，建议参考送样指南
	三代Sequel基因组测序（20K及以上）	血液	≥10ml
		新鲜组织	≥1g
		细胞	≥1x107
		植物组织	≥5g
		菌体	≥5g
	三代Sequel基因组测序（10K）	血液	≥5ml
		新鲜组织	≥500mg
		细胞	≥1x107
		植物组织	≥3g
		菌体	≥2g
	CRISPR Screen	细胞	≥5x107
RNA文库	真核转录组测序（非链特异性/链特异性）	血液	≥1ml
		新鲜组织	≥200mg
		细胞	≥5x106
		植物组织	≥300mg
		菌体	≥200mg
	长链非编码RNA测序（LncRNA）（链特异性/非链特异性）	血液	≥2ml
		新鲜组织	≥300mg
		细胞	≥1x107
		植物组织	≥300mg
		菌体	≥300mg
	原核转录组测序	菌体	≥300mg
	Small RNA测序	血液	≥2ml
		新鲜组织	≥300mg
		细胞	≥1x107
		植物组织	≥500mg
		菌体	≥300mg
	全转录组测序	血液	≥3ml
		新鲜组织	≥500mg
		细胞	≥1x107
		植物组织	≥1g
		菌体	≥500mg
	三代全长转录组	血液	≥2ml
		新鲜组织	≥300mg
		细胞	≥1x107
		植物组织	≥500mg
		菌体	≥300mg
	免疫组库测序/杂交瘤测序	血液	≥2ml
		新鲜组织	≥300mg
		细胞	≥5x106

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