我们这次将用一个真实案例，带领大家使用君跻基因&唯信计算的AI辅助设计功能。重点看看该功能如何使用，以及AI到底是怎么想问题的——它凭什么推荐这些回复突变？它怎么权衡亲和力、稳定性、可开发性？它输出的设计方案为什么是这种组合？把这些问题搞清楚了，AI才能够真正辅助寻找潜在靶点。

AI辅助设计具体步骤

首先进入君跻官网“AI工具”（网址：https://gbs.gentlegen.com/Wemol），我们提供分子生成模型、人源化与免疫原性预测、可开发性预测与制剂开发服务。

点击“申请试用”留下相关信息后，我们将发送账号信息至您的邮箱，邮件可跳转进入WeMol网页版（网址：https://wemol.wecomput.com/ui/#/frontend/login）。在模板中点击您想要的。

我们支持Protein、Antibody、Small Molecule、Peptide等多领域，超两百种的计算模块，并附以模块信息、介绍文档等。

以下将以“Antibody Humanization HTS v1.6”作为示例，完整进行一次AI计算。 

• 第一步：序列导入

导入Fasta格式的氨基酸序列，这里以mH35作为示例。进行Antibody以及Nanobody的人源化，这里选择Antibody。

• 第二步：设置参数

右侧面板，根据需求选择具体的编号规则，平台将自动编号。左侧的序列面板可以看到具体的CDR区残基。根据需求选择最终返回的推荐模板数量，一般默认30条。自动保存便于后期查找、修改。

完成后左侧可查看序列比对、评分情况，切换查看重轻链模板序列比对情况。

• 第三步：回复突变评分

右侧面板展示了基于算法推荐的人源模板组合，也可指定任意重轻链模板。

确认模板后，点击下方“回复突变排序”，平台将基于该组模板进行后续回复突变设计。此处选择的供体及模板，将作为数据报告的文件名，如选择mH35和第一组模板IGLV7-46*01、IGHV7-4-1*02，最终报告文件名将为“<Humanization Report> mH35.l, mH35.h, LV7-46*01, HV7-4-1*02”。

完成回复突变评分后，左侧序列也将以柱状图形式显示，方便对比。

对于评分高的位点，可以点击表格中的“位点视图”，查看该推荐位点在序列和结构上的位置情况。

• 第四步：回复突变组合

平台进一步对回复突变进行分组，并给出评分。

完整性分数越高，越有利于维持亲和力；人源性分数越高，人源化程度越高，免疫原性风险越低。同样可增加或删除组合。

• 第五步：最终报告生成

基于选定的模板和回复突变组合，“生成报告与序列”。

左侧“humanized”的分组查看最终重轻链人源化变体序列。点击上方“PTM”或“Immunogenicity”，可以继续进行PTM及免疫原性的可视化分析。

“作业”区查看生成报告，如“<Humanization Report> mH35.l, mH35.h, LV7-46*01, HV7-4-1*02”的“报告”一栏显示了人源化设计总结报告，人源化后的序列，中英文专利实施例，回复突变分组，PTM分析结果等内容，选取所需报告进行下载。

• 第六步：人源化变体结构生成

返回上方“View”区，可对所设计的人源化变体序列进行结构预测。

点击“变体名称”，可以分别显示对应突变体与母本的结构差异，同时计算变体稳定性及其与原抗体CDR的RMSD差异。

• 注意事项

若不慎关闭窗口，需要继续或修改流程，可在“数据”区“历史文件”中，点击“链名.weview”进行相关操作。

设计方案出来之后，自动化验证怎么接？

“AI设计”与“自动化验证”的进一步连接，形成了从候选分子生成、实验构建、功能验证到数据反馈的闭环流程，为创新药物早期研发提供更加高效、标准化、可迭代的解决方案。

AI设计跑完，下一步就是把候选分子清单传给君跻生物进行快速合成。

君跻生物依托自主研发的GentSyn-Exp3.0G-Lab全自动化生产线，打造了从基因设计、合成、验证到蛋白表达及抗体亲和力表征的一站式、高通量技术平台。传统研发模式依赖大量人工验证，而君跻生物用自动化重新定义了湿实验的效率和成本。IgG单抗259元/条、VHH纳米抗体129元/条。过去只够合成一两条抗体的预算，如今可在君跻生物完成数十条抗体的高通量筛选。

君跻生物的G-Lab全自动化基因抗体平台，将通过前沿的自动化技术、极速的交付实力、严谨的安全质控，为您的生物医药创新项目持续注入强劲动能！君跻生物可提供相关服务。如需了解相关服务详细，可发送邮件至marketing@gentlegen.com。